實現水生態健康現場診斷與預警集成
　　“太湖流域（江蘇）水生態監控系統建設與業務化運行示范”課題旨在通過太湖流域水生態系統健康性和完整性監測與評價核心技術、水生態健康現場診斷及應急監測集成技術、流域重大工程水生態影響監控與評估技術的研發，加強生態和生物監測技術集成，初步構建太湖流域水生態系統綜合監測toc分析儀與監控評估技術方法體系及太湖生態變化監控系統平臺，監控太湖流域水生態系統健康狀態及演變，實現水生態健康現場診斷與預警集成，動態評估重大工程等人為干擾下的生態系統變化。
　　開展太湖流域水生態監控技術方法體系業務化運行示范、初步建立流域水生態監控網絡及業務化運行模式，形成太湖流域水生態監測與監控能力，建立太湖流域水生態網絡體系，實現水生態系統長期動態變化監控、流域生態風險識別及防范。
　　課題的終目標是為實現太湖流域水生態健康管理和水生態環境功能分區管理提供科學和技術支撐，為太湖流域形成水生態監控業務推進和應用能力提供實踐支撐，并進一步推動管理上生物目標的確定，整體促進水質目標管理向水生態健康管理的重大轉變。
　　針對太湖流域由水質目標管理向水生態健康管理轉變、實施水生態環境功能分區管理的發展趨勢以及流域水生態監測技術薄弱的現狀，“十二五”期間，江蘇省環境監測中心牽頭組織開展了“太湖流域（江蘇）水生態監控系統建設與業務行示范”課題研究。課題分屬國家水體污染控制與治理科技重大專項流域水污染防治監控預警技術與綜合示范主題太湖流域水環境管理技術集成綜合示范項目。
　　以江蘇省太湖流域為研究區域，由江蘇省環境監測中心、常州市環境監測中心、南京大學等單位組成的課題組布設了120個點位，開展太湖流域水生態基礎調查，其中太湖湖體29個、中小型湖蕩20個、河流40個、上游水庫15個、上游溪流16個。
　　課題組分別于2012年~2014年豐、平、枯不同水期對流域水生態現狀開展調查，獲得流域層面的水生態基礎數據，包括浮游藻類、大型底棲動物、浮游動物、水生植被、水質生物毒性等及常規水質理化指標共約20萬個數據。
　　在120個點位豐、平、枯3個水期生態調查數據的基礎上，經過科學篩選，課題組終確定流域水生態變化監測業務化運行監控點位39個，并于2014年~2015年開展流域水生態監測業務化運行。
　　此外，課題組還搜集整理了2008年~toc分析儀2015年太湖藍藻遙感影像數據，太湖周邊17個氣象觀測站點2012年~2015年氣壓、風速、風向、氣溫、露點、降水量等氣象資料，太湖流域26條主要出入湖河流的氮、磷等監測數據，2008年~2015年太湖湖體的巡測數據（包括溶解氧、氨氮、藻類密度、高錳酸鹽指數和葉綠素a等），太湖2006年~2015年浮游動物、浮游藻類及大型底棲動物等全序列調查監測數據，梅梁湖2008年~2015年藻毒素監測數據，太湖湖體及流域省界、市界、入湖河流、出湖河流等河流水質自動監測數據，2010年~2015年太湖流域土地利用類型遙感影像及解譯結果等基礎數據資料。
　　2016年4月17日，《江蘇省太湖流域水生態環境功能區劃（試行）》（以下簡稱《區劃》）得到江蘇省政府批復。為落實《區劃》，依托課題研究成果，在確保科學性的基礎上，從業務化運行可行性的角度，課題組編制了《太湖流域（江蘇）水生態健康評估技術規程（試行）》《水生態健康監測技術規程 淡水大型底棲無脊椎動物（試行）》《水生態健康監測技術規程 淡水浮游藻類（試行）》3個技術規程，為《區劃》的實施提供技術支撐。